办公系统English

清华大学“青年千人”曾坚阳教授学术讲座预告

点击[] 时间[ 2017年10月09日 17:02] 发布人[]

讲座时间:2017年10月10日 14:00-15:00

讲座地点:北航新主楼B121

Abstract:              

The emergence of large-scale genomic, chemical and pharmacological data provides new opportunities for drug discovery and repositioning. In this talk, I will present our recent progress on applying machine learning algorithms for drug-target interaction prediction and computational drug repositioning (i.e., finding the new uses of old drugs). First, we develop a new computational pipeline, called DTINet, to predict novel drug-target interactions (DTIs) from a constructed heterogeneous network, which integrates diverse drug-related information. Second, we propose DeepCPI, a new framework that combines feature embedding (a technique of representation learning) with deep learning for predicting compound-protein interactions at large scale. In addition to comprehensive computational tests on real biological data, we have we have experimentally validated a number of new interactions predicted by our methods for several important protein targets, including COX proteins, and the GPCR proteins GLP-1R and RXFP4. Both our computational and wet-lab experimental results suggest that our algorithms can offer a useful and powerful pipeline for drug development and drug repositioning at large scale.

简介:

曾坚阳,清华大学交叉信息研究院,Tenure-track助理教授,博士生导师,入选中组部组织的第五批青年千人计划。于1999年和2002年分别获得浙江大学的学士和硕士学位。2011年,在美国杜克大学(Duke University)获得计算机科学博士学位。2011年至2012年期间,在杜克大学计算机科学系和杜克医学院从事博士后研究。2012年作为海外人才被引进清华大学交叉信息研究院。目前主要研究方向包括计算生物学、机器学习和大规模数据分析。已在国际核心期刊和会议上发表论文40余篇,其中包括《自然》(Nature)杂志、《自然》杂志子刊《自然通讯》(Nature Communications)、《细胞》杂志子刊《细胞系统》(Cell Systems)Nucleic Acids ResearchBioinformaticsIEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics、计算生物学和人工智能领域的国际一流会议RECOMBISMBAAAI等。在计算生物学领域和人工智能的国际一流会议ISMBRECOMBIJCAI上担任程序委员会委员。

新闻动态更多 >>
友情链接 北京航空航天大学国内外大学上级机关驻华使领馆百度谷歌后台管理

电话:010-82338050 传真:010-82339376 地址:北京海淀区学院路37号 邮编:100191 Email:fao@buaa.edu.cn
International Division BUAA © 2007/privacy Polilcy